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 三軍總醫院海底暨高壓氧醫學部為積極服務病患，並著重於臨床高壓氧醫學的研究、應用及其相關基礎研究，由受過專業訓練的醫護人員負責，實際進行高壓氧治療的臨床服務。
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高壓氧醫學部之任務：
1. 提供國內休閒、軍事及職業潛水人員完整之健康諮詢及醫療服務。
2. 提供國內病患正確有效之高壓氧治療服務。
3. 提供高壓氧醫學相關醫療人員之教育訓練。
4. 研發高壓氧氣治療新的適應症，並提供明確的臨床証據。
高壓氧醫學之願景：
1. 使三軍總醫院成為國內有能力治療並訓練處理潛水相關疾病的醫學中心。
2. 讓所有急性減壓症病患能獲得完整治療，其後遺症在國內終將絕跡。
3. 讓每一位高壓氧適應症患者皆能接受完整高壓氧氣治療，減少醫療憾事並降低醫療及社會成本。
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